Entegre program kullanmanın en önemli faydası, iş akışlarını kuruma özel şekilde ayarlayabilme ve diğer uygulamaları rahatlıkla kontrol edebilme olanağı sağlamasıdır. Bu sayede kurumun faaliyet alanına ve iş akışına uygun düzenlemeler yapılarak verimlilik arttırılabilir.

Muhasebede entegre etmek, bir e-ticaret sitesindeki satış, stok, çek/senet, cari hesaplar gibi konulardaki değişimleri tek bir giriş ile muhasebe programlarında düzenlemeyi sağlayan programları ifade eder. Bu sayede veri tutarlılığı sağlanabilir ve iş akışları daha verimli hale getirilebilir.

Bir bilgisayar muhasebe yazılımı seçerken dikkate alınması gereken başlıca kriterler şunlardır: yazılımın işlevleri ve teknolojik özellikleri, satıcı güvenilirliği ve destek gücü, kullanım kolaylığı ve yazılım maliyetleri. Bu kriterler doğrultusunda doğru yazılım seçimi yapılarak iş süreçlerinin verimliliği arttırılabilir.

Entegre programlar, birden fazla alt sistemi tek bir üst sistemde birleştiren sistemlerdir. Bilgisayar ağları, uygulamalar, programlar ve yazılımlar aracılığıyla farklı teknik temeller üzerinde çalışan entegrasyon sistemleri, verimlilik ve veri akışında uyumu sağlarlar.

Mikro entegre, ofis bağımsız bir satış deneyimi sunarak Mikro Muhasebe ve Mikro satış takip programına entegre çalışmayı sağlar. Bu sayede saha ekiplerinin işlemlerini kolaylaştırabilir ve mobil çalışma olanaklarını artırabilir.

Entegre işlemi, yazılımların sistemlerin uyumlu bir şekilde otomatik yapıda haberleşmesi ve veri alışverişinde bulunması anlamına gelir. Bu sayede veri bütünlüğü sağlanabilir ve iş süreçleri daha verimli hale getirilebilir.

Mikro muhasebe programı ise ön muhasebe programı ile entegre çalışarak tüm kayıtların muhasebe kaydı olarak tutulmasını sağlar. Böylece resmi evrakların düzenlenmesi ve devlete iletilmesi süreçleri kolaylaştırılarak muhasebe işlemleri verimlilik kazanabilir.