Homoloji modelleme yöntemi nedir?
homoloji modelleme, deneysel yöntemlerle modelleri ortaya konmuş olan proteinlerin yapılarını, domainlerini baz alarak elinizdeki amino asit dizisini 3 boyutlu olarak modellemedir.
Protein modelleme nedir?
Hesaplamalı protein dizaynı (moleküler modelleme) hedef protein yapısında düşük enerji etkileşimleri oluşturacak amino asit dizilerini tanımlamaya çalışır. Yöntemin en önemli kısıtlığı yapısal ve fonksiyonel spesifite ile ilgili algoritmaların geliştirilebilmesindeki zorluktur.
Homolog sekans nedir?
Homolog sekans nedir?
Sekans homolojisi, sekanslar arasındaki evrimsel ilişkiyi gösteren daha genel bir terimdir. İki sekansı karşılaştırırken sekans homolojisi yüzdesinden bahsetmek yaygındır, ancak bu yüzde aynı ve benzer alanların bir karışımını içerebilir. Son olarak, dizi homolojisi diziler arasındaki evrimsel ilişkiyi ifade eder.
Proteinler neden türe özgüdür?
Proteinler neden türe özgüdür?
Proteinlerin çok çeşitte görevler üstlenmelerinden dolayı, yapıları da oldukça farklıdır. Her protein türü, kendine özgü 3 boyutlu yapıya sahiptir. Bir proteini bir diğer proteinden ayıran temel şey, amino asitlerin dizilimidir – ki bu dizilim de o amino asit dizisini kodlayan genetik dizilim tarafından dikte edilir.
Homoloji testi nedir?
1948'de Richard Owen tarafından bilime kazandırlan homoloji kavramı, proteinlerde iki farklı amino asit dizisi örneği veya DNA'daki iki farklı DNA dizisi arasında meydana gelen eşleşmeleri karşılaştırarak ve hizalamda gerçekleşen eşleşmelere puan atayarak ölçülür.
Sekonder yapı ne demek?
Sekonder yapı. Birincil yapıdaki polimerin veya makromolekülün sarmal, tabakalı yapı gibi daha ileri bir düzenleme göstermesi. Hidrojen bağı ve diğer zayıf bağlarla oluşturulan makromolekül yapıları.
Protein stabilitesi nedir?
Protein stabilitesi nedir?
Tüm biyolojik işlemler proteinin kendine özgü ve görev aldığı iş için uygun olan konformasayona katlanması ve bu konformasyonda kararlılığını koruyabilmesine (stabilite) bağlıdır. Fizolojik koşullar altında bir protein molekülü düzensizlik ve düzen arasında geçiş durumundadır. Bu olaya katlanma/ açılma denir.
