Laboratuvarda kullanılan malzemelerin steril edilmesi oldukça önemlidir, çünkü mikroorganizmaların bulaşmasını önleyerek doğru sonuçlar elde edilmesini sağlar. Yüksek ısıya dayanıklı olmayan malzemeler genellikle ısıl işlemlerle steril edilemez, bu nedenle steril ambalajlı tek kullanımlık malzemeler tercih edilebilir.

Serum sterilizasyonunda sıvı, hızla ısıtılarak belirli bir sıcaklıkta belirli bir süre tutulur ve ardından hızla soğutularak steril kaplara konur. Bu işlem aseptik koşullarda gerçekleştirilir ve mikroorganizmaların öldürülmesini sağlar.

Sterilizatörler, laboratuvarlarda cam malzemelerin sterilizasyonunda kullanılan cihazlardır. Kuru hava sterilizatörleri genellikle petri kutuları, pipet gibi cam malzemeleri sterilize etmek için kullanılır. Ancak plastik, kauçuk gibi ısıya duyarlı malzemelerde kullanılamaz. Hastanelerde cerrahi aletlerin sterilizasyonunda da sıklıkla kuru hava sterilizatörleri tercih edilir.

Mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan bazı malzemeler arasında Arsenik Tayin Aparatı da bulunmaktadır. Bu tür malzemelerin sterilizasyonu, doğru tekniklerin kullanılmasıyla mikroorganizmaların uzaklaştırılmasını sağlar.

Dezenfeksiyon işlemi mikroorganizmaların azaltılması veya öldürülmesini amaçlar. Ancak bakteri sporları, dezenfektanın tipine ve dozuna bağlı olarak farklı düzeylerde etkilenirler. Uzun süreli ve etkili bir dezenfeksiyon işlemi, sporları öldürebilir.

Mikrobiyoloji laboratuvarı bölümleri arasında klinik mikrobiyoloji laboratuvarı alt bölümleri bulunmaktadır. Bu alt bölümler klinik bakteriyoloji, klinik viroloji, mikoloji ve parazitoloji üzerine odaklanmıştır ve mikroorganizmaların teşhis ve tanısında önemli bir rol oynarlar. Her bir alt bölüm farklı testler ve analizler yaparak sağlık sektöründe önemli bir yere sahiptir.