Uc sarmallı DNA
DNA Deoksi Ribo Nukleik Asitisimli bir tur molekul grubunun kısaltılmış isimidir
imagesdnauclusunedir5afb2f012a03d
Uc iplikcikli DNA veya uc sarmallı DNA, uc oligonukleotitin birbiri etrafına sarılarak uclu sarmal oluşturduğu bir DNA yapısıdır Bu yapıda iplikciklerden biri, Bbicimli DNA ile Hoogsteen veya ters Hoogsteen hidrojen bağları kurar Bu bağ, ikili sarmalın buyuk oluğunda oluşur
Orneğin, bir T nukleobazı, WatsonCrick baz eşleşmesi ile oluşmuş bir AT baz ciftindeki A ile Hoogsteen hidrojen bağları kurarak bir AxT cifti oluşturur (x bir Hoogsteen baz ciftine karşılık gelir) N3 pozisyonunda protonlaşmış bir sitozin (C+ olarak temsil edilir) bir GC ciftindeki G ile bağ kurarak bir GxC+ cifti oluşturur Bu Hoogsteen eşleşmeleri ile oluşan DNA uclu sarmalları iki homopirimidin ve bir homopurin iplikcikten oluşur, homopirimdin olan ucuncu sarmal, homopurin olan iplikcikle aynı doğrultudadır (Homopurin ve homopirimidin, sadece purin veya pirimidinlerden oluşan DNA iplikcikleri demektir)
Homopurin olan bir ucuncu iplikcik ayrıca homopurinhomopirimidin ikiliye ters Hoogsteen bağlarıyla da bağlanabilir Bu yapıda olan uclulerde, A bazı bir TA ciftine, G'da bir CG ciftine bağlanır Ucuncu iplikcikteki bazlar ters donmek zorunda oldukları icin, homopurin olan ucuncu iplikcik, orijinal ikili sarmaldaki homopurin iplikciğin tersi doğrultusundadır (yani antiparaleldir)
Uc iplikcikli DNA ilk defa 1957'de betimlenmiştir O zaman E coli rekombinaz enzimi RecA'nın bir reaksiyon ara urunu olduğu gorulmuştuUclu DNA'nın bu surecteki rolu bilinmemektedir
DNA ikili sarmallarına bağlanarak uclu yapılar oluşturacak oligonukleotitler kullanmanın laboratuvarda mutasyonlara ve rekombinmasyona neden olduğu, ayrıca transkripsiyonu engelleyebildiği bulunmuştur Bu yontemin biyoteknoloji ve tedavide kullanılması beklenmektedir
DNA Deoksi Ribo Nukleik Asitisimli bir tur molekul grubunun kısaltılmış isimidir
imagesdnauclusunedir5afb2f012a03d
Uc iplikcikli DNA veya uc sarmallı DNA, uc oligonukleotitin birbiri etrafına sarılarak uclu sarmal oluşturduğu bir DNA yapısıdır Bu yapıda iplikciklerden biri, Bbicimli DNA ile Hoogsteen veya ters Hoogsteen hidrojen bağları kurar Bu bağ, ikili sarmalın buyuk oluğunda oluşur
Orneğin, bir T nukleobazı, WatsonCrick baz eşleşmesi ile oluşmuş bir AT baz ciftindeki A ile Hoogsteen hidrojen bağları kurarak bir AxT cifti oluşturur (x bir Hoogsteen baz ciftine karşılık gelir) N3 pozisyonunda protonlaşmış bir sitozin (C+ olarak temsil edilir) bir GC ciftindeki G ile bağ kurarak bir GxC+ cifti oluşturur Bu Hoogsteen eşleşmeleri ile oluşan DNA uclu sarmalları iki homopirimidin ve bir homopurin iplikcikten oluşur, homopirimdin olan ucuncu sarmal, homopurin olan iplikcikle aynı doğrultudadır (Homopurin ve homopirimidin, sadece purin veya pirimidinlerden oluşan DNA iplikcikleri demektir)
Homopurin olan bir ucuncu iplikcik ayrıca homopurinhomopirimidin ikiliye ters Hoogsteen bağlarıyla da bağlanabilir Bu yapıda olan uclulerde, A bazı bir TA ciftine, G'da bir CG ciftine bağlanır Ucuncu iplikcikteki bazlar ters donmek zorunda oldukları icin, homopurin olan ucuncu iplikcik, orijinal ikili sarmaldaki homopurin iplikciğin tersi doğrultusundadır (yani antiparaleldir)
Uc iplikcikli DNA ilk defa 1957'de betimlenmiştir O zaman E coli rekombinaz enzimi RecA'nın bir reaksiyon ara urunu olduğu gorulmuştuUclu DNA'nın bu surecteki rolu bilinmemektedir
DNA ikili sarmallarına bağlanarak uclu yapılar oluşturacak oligonukleotitler kullanmanın laboratuvarda mutasyonlara ve rekombinmasyona neden olduğu, ayrıca transkripsiyonu engelleyebildiği bulunmuştur Bu yontemin biyoteknoloji ve tedavide kullanılması beklenmektedir